也有人怀疑是斯大林的另一红人赫鲁晓夫主导了“医生案件”，赫鲁晓夫可是从斯大林去世一事上获利最大的人，在斯大林过世后，他左手搞掉贝利亚，右手搞掉马林科夫，干净利落地成为克里姆林宫的新主人。持这种观点的人认为，既然贝利亚是斯大林保健事务的负责人，那么，若斯大林真的对“医生案件”展开调查，早晚会查到贝利亚头上。当斯大林权势正旺时，赫鲁晓夫和贝利亚、马林科夫是同一战壕的战友，共同抵制那些威胁这个小圈子利益的人物、团体；而当斯大林要交出权力时，赫鲁晓夫、贝利亚、马林科夫就成了竞争对手，他们都渴望坐上克里姆林宫的头把交椅。贝利亚比马林科夫厉害得多，是赫鲁晓夫最担心的人之一。
赫鲁晓夫自己在回忆起“医生案件”时，似乎并不愿意谈得很深入，只是说那些医生是斯大林怀疑心的牺牲品。
1956年6月30日，苏共中央出台了一份《克服个人迷信及其后果》的决议。苏共中央承认，在斯大林以及斯大林的小圈子权炽之时，中央内部确实存在一股抵御斯大林及其小圈子的力量，这股力量奉行列宁主义，不想成为斯大林专断独行的受害者。
也就是说，斯大林担心克里姆林宫之中存在反对自己的人，并不是凭空臆想。在斯大林生命的最后一段日子，这股奉行列宁主义的力量已经发展到可以在公开场合和斯大林分庭抗礼的程度了，这种抗争在“医生案件”中也有所体现。
1953年2月，斯大林在苏共中央的一次会议上，要求在3月中旬对“医生案件”进行审理，还颇为认真地将医生们的罪行一一发给大家。在关于“医生案件”的报告中，调查人员认为，美国的力量已经渗透进克里姆林宫的医疗机构，并在党中央一些关键部门设置了通讯点，还旧事重提，再次提醒大家注意“列宁格勒案件”，说库兹涅佐夫等人就是被这些渗透进克里姆林宫的西方力量争取走的。斯大林曾和英美领导人打过多次交道，对英美两国的一些间谍战做法非常清楚，他毫不怀疑这份报告的真实性。不管指使莉季亚·季玛舒克写告密信的人是谁，也不管制造“医生案件”的人是什么目的，斯大林都没有疑议地落入了圈套。
贝利亚、马林科夫、赫鲁晓夫这些和斯大林最亲近的人，自然都仔仔细细地研究了“医生案件”的资料。赫鲁晓夫建议大家去莫斯科森林里，一边打猎，一边探讨问题，前苏联的政要们多喜欢在“游山玩水”时，讨论秘密且重大的事情。赫鲁晓夫一行打猎回来，达成了一个重要共识--斯大林已经太老了，健康不佳，无法再担任任何政府职务。
3月1日，苏共中央主席团委员卡冈诺维奇在主席团会议上宣布，应该重新对“医生案件”进行调查，最后成立一个专门的调查委员会，以确保调查的公正性。此前，斯大林曾下令将前苏联的犹太人强制迁往偏远地区，而在主席团会议上，斯大林的这一提议也被不留情面地驳回了。与会代表大部分都对卡冈诺维奇的意见表示赞同，这让斯大林受到了很大的打击，他清楚地察觉到，一股意在和他对着干的力量悄然崛起。斯大林当即就发火了，声称要好好惩罚下造反的人。
不过，这些决意造斯大林反的人，也并没有退缩的意思，这些人从一开始就清楚，只要斯大林手上还有权力，他就能随心所欲地制裁那些让他感到不快的人，因此，卡冈诺维奇等人在主席团会议召开前，就为自己找好了退路。米高扬冷静地告诉暴怒中的斯大林，军队就守在克里姆林宫门口，如果主席团成员在半个小时内还不能毫发无损地走出克里姆林宫，军队就会开进来控制局势。
尽管不清楚贝利亚等人是否也和陈兵克里姆林宫一事有关，但贝利亚最后确实站到了卡冈诺维奇等人这边，表示尊重主席团的意见。
斯大林被孤立了，悻悻回到了他在孔策沃的别墅。1953年3月2日，人们发现斯大林因脑溢血晕倒在地，医生们拼尽全力抢救这位在前苏联历史上堪称巨人的政治家，丝毫没有因为前不久发生的“医生案件”影响了心情，却无奈回天乏术。3月5日，斯大林离开人世，临去世之前，斯大林的手微微颤动，嘴唇一张一阖，似乎要说什么，但始终没能说出口。
斯大林走了，没有留下什么遗言，按照传统，他的遗体要在克里姆林宫中停放几日后，被送到莫斯科红场的列宁墓。赫鲁晓夫、马林科夫、贝利亚、卡冈诺维奇、伏罗希洛夫都参加了斯大林的守灵仪式，也各有一番心思。贝利亚在斯大林去世后，立刻容光焕发了，作为当时前苏联政坛的二把手，贝利亚自以为会一帆风顺地成为克里姆林宫的新主人，然而他失算了，赫鲁晓夫成了莫斯科最终的胜利者。